入城当夜，锦衣卫即与京营兵分数路，直扑府衙与大商巨贾宅邸。
杭州知府沈应之尚未逃出城，便已被擒。
押解至府前广场，五花大绑，百姓围观。
徐林负伤上阵，亲手指认：“此贼勾结商贾，煽动乱民，图谋刺杀朝廷命官，罪无可赦！”
沈应之大叫冤枉，却被一脚踹翻，现场即刻斩首祭旗。
与此同时，杭州十余户大商之门被尽数封禁，私宅查抄，账本收缴，连夜审讯。
绸商李家，盐商潘家，钱庄何氏……一个接一个倒下，卷宗从杭州一路送至应天，再入京中。
十日内，杭城权贵血流成河，财富巨变，朝廷鹰犬重塑秩序。
然而，这场“清洗”，却也引发了意料之外的剧烈反弹。
先是各地商贾暗中串联，纷纷上书抗议“秋后算账”。
但真正点燃风暴的，是来自江南书院的年轻士子。
江南素多名士，学风昌盛，书院遍布。
杭州之乱平息后三日，震泽书院首倡“抗议武力镇压，声援士绅”，百余士子罢课集会，随后苏州洞庭书院、嘉兴文澜书社、绍兴白石讲堂纷纷响应。
十日内，浙江十三州府，竟有七地士子集会示威，焚贴条陈、朗诵檄文，怒声斥责锦衣卫滥权、朝廷苛暴。
杭州城南，文庙前，聚集千余人，横幅高悬，写着：“杀民者为贼，披甲者为寇！”
书院讲师、读书子弟，衣冠楚楚，却怒火中烧。
“徐林者，非朝廷之义士，乃鹰犬走卒，焚我书屋，掳我亲师，其心可诛！”
“锦衣卫之设，原为卫国，今者反噬生民，视士人如草芥，岂有王法！”
有士子登高振臂，声震八方：
“今我士子，聚于此非为乱，而为理！问天下公义何在？问朝廷心向何方？”
“倘若忠言不被采纳，今日尚可讲理，明日，江南恐将无安席！”
朝廷大员急欲压下风波，但局面已非一朝一夕可控。
各地书院上书朝廷，章程连绵，措辞激烈。
一时之间，京中朝臣亦起争论。
言官主张弹劾锦衣卫横征暴敛，执法不公；
军方则认为，若不镇压，地方将陷更大之乱。
而首辅徐谦，面对诸多批评，却只是冷眼旁观，淡淡说道：
“江南书生，不过纸上谈兵，若真有胆，不妨让他们
…。。