当局以特殊时期为借口，下令实行联保制度，一人因政治思想“不纯正”被判罪，其他人都要连坐。面对这样的无理做法，傅斯年挺身而出，愤慨地对当局声明，台大师生由他一人担保，发生问题，他负全部责任。把台大的师生，置于自己的保护之下。
这一年的7月11日，一个叫叶青的国民党高官，在《民族报》发表公开信，攻击傅斯年主持下的台大“优待共产党”。罪名一是台大教授李齐突然离开，未经系主任、院长同意，只是留信一封，说是请假，传闻先到香港，后到大陆。另一副教授张则是办好了请假手续，送家眷去广州，校方仍发薪水。二是法学院院长萨孟武“参共亲共”、“台湾大学中有些院长和系主任还是共.党分子或亲共分子，他们把持院系，排拒异己，正是把他们底院系变成共产党细菌的温床”。
7月14日，傅斯年在同一报纸发表《傅斯年校长的声明》，一一予以驳斥，并断然表示“学校不兼警察任务”、“但是我不兼办警察，更不兼办特工”。声明义正词严，将这无耻的公开信驳得体无完肤。
假如没有傅斯年，台湾大学在那样动荡的时局中，想要在短时间中迅速崛起、发扬光大，奠定一个现代大学的基础，是很难想象的。