、钱端升、罗隆基、梁漱溟等52名参政员，联名上书蒋介石，弹劾孔祥熙，全盘否定其“一切措施不副内外之望”。
众怒难犯，老蒋不得不考虑。又以中日桂南战役为由，不愿政局变动过大。拖至1939年11月，孔祥熙改任行政院副院长，实权未减多少，但威信大损，
孔祥熙并未就此收敛，而是贪赃枉法，肆无忌惮，黑手伸入抗战救国款、救命款。
1942年，美国政府援华抗战，贷给中国五亿美元。1943年，国民政府财政部决定提取其中1亿美元为准备金，发行“同盟胜利美金储蓄券”。孔祥熙伙同国库局长等下属，私设公司，巧立名目，中饱私囊，将尚未售出的350万美元储蓄券按官价购进予以贪污，还有799.5万美元的储蓄券由中央银行其他人员购进私分。
国库局负责出售这笔资金的两名青年工作人员，给傅斯年寄去几页账本。这时候傅斯年很有政治经验，也谙熟斗争策略。
第一，收集人证物证。第二，耐心等待时机。
1945年7月，在国民参政会四届一次大会上，傅斯年领衔提案，21名参政员联署，题为《彻查中央银行、中央信托局历年积弊，严加整顿，惩罚罪人，以重国家之要务而肃官常案》，要求彻查、改组、追责。
傅斯年一阵炮轰，震惊朝野。
蒋介石坐不住了，邀请傅斯年吃饭，想替孔说情。于是便有了著名的蒋傅对答。
蒋问：“孟真先生，信任我吗？”
傅答：“绝对信任。”
这时候的傅斯年还很懂斗争策略，他的这个回答很得蒋介石欢心。
蒋说：“你既然信也该信任我所用的人。”
傅正色道：“委员长我是信任的，至于说因为信任你，也该信任你所任用的人，那么，砍掉我的脑袋，我也不能这样说！”
老蒋虽然护短，还是欣赏傅斯年的公心和正直，也有雅量听他的逆耳诤言。于是派财政部次长俞鸿钧等人去核查，一查一个准。
1944年11月，孔祥熙免兼财政部长。1945年5月，孔祥熙再丢行政院副院长职务。1945年7月25日，孔祥熙被免去中央银行总裁、四行联合办事处副主.席职务。
抗战胜利后的国民经济每况愈下。在1945年接替孔祥熙担任行政院长的宋子文推出了错误政策，而其小集团惊人腐败，被认为是造成经济衰退的罪人。
1947年，傅斯年对宋子文的行
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