内，或征伐于外，俱由天子决断。
除此之外，各方军伍仍须举荐士伍贤良勇力，并成精军六万为驻洛禁卫，并为六军后补。
同时，多达数十万的王师军队，各依边务督镇划为八大军区，各军区将主号为大都督，专职征讨。大都督下并设军司使掌管征兵练新事宜，军务使掌管钱粮器械，勋务使司职计勋犒慰，三使俱由台中委派，并助大都督镇边定乱讨逆扬威。
原治中各军府府事肃整，专督军屯、制械、征练、给役等事宜，唯各军区用事大小而调度输送兵员、粮械，不再参与一线作战。
同时台城兵部下设止戈司，并于诸州县悉设分署，主持老卒卸甲归耕、力士夸功桑梓、年节慰问兵属等事宜。
当然，诸种改制也只是大概框定，至于真正推行改革，还是要延后到新的大业元年。届时，荆州军镇将被纳入第一批的改制中，一旦改制完成则西南诸军齐出，力求一战而灭成汉，收复蜀中！