军的围剿之下，沙定州最终走投无路，坐困孤城，无奈只能投降。
随着沙定州的投降，这场前后持续了两年多的叛乱终于落下了帷幕，云南那边已把沙定州同其家人还有部下押解来京，迎接他们的是国法的严厉处置。
随着沙定州的叛乱平定后，云南地方也逐步恢复了秩序，但这场叛乱给云南带来的深远影响是极大的，尤其是黔国公沐天波在云南的威望大跌，假如不是因为沐天波的疏忽大意，导致沙定州如此轻易得手，哪能会发生这样的事呢？
此外，就是近半个云南卷入战火之中，遭到了极其严重的损失。现在叛乱平定，后续云南这边还有许多事要做，尤其是对地方的安抚和秩序恢复等等，这都需要中枢拿出意见来，这个时候朱慎锥以皇帝身份向内阁提议，顺势推动云南的改土归流，不仅要重设地方官府衙门，还要向云南派遣官员和移民，而所派的官员包括正常任命之外，那就是在这一次卷入黄河决堤案中但不是主责而被处置的这些官员，包括当地士绅大族和官宦世家等，把这些人全部送到云南去，让其戴罪立功，并把其家人移民地方，也算是物尽其用了。