所以朱慎锥考虑到这种情况打算从根本上来解决这个问题，但因为两京制度在目前暂时无法取消，大明上下也不能让朱慎锥彻底废除南京六部，不再让南京作为南都的存在。
由于这个原因，朱慎锥只能采取釜底抽薪的办法，一方面派人牢牢掌控住南直隶的话语权，比如现在的张锡钧依旧在南京，代替朱慎锥掌控南直隶。另个就是直接消除掉浙江来自于南京的影响力，可如果要这么做的话，仅仅靠往浙江派一个布政使或者巡抚是完全不成的，因为他们的官职和地位根本无法和南京六部抗衡，所以只能把浙江从行政区域和南方的福建进行合并，成为一个新的总督治区，派遣一个闽浙总督以管辖两省，掌控两省军政，这样一来就能大大削弱南京对浙江的影响，让浙江彻底脱离南京的控制。
至于第二个原因就是郑芝龙了，一直以来朱慎锥都在谋划和布置解决郑芝龙的问题，通过不断调整福建官员和派遣锦衣卫秘查和拉拢郑芝龙的部下为后续做准备。
可仅仅这些还远远不够，郑芝龙在福建的实力太过强大，朱慎锥还担心一旦举动过大非但无法解决郑芝龙，甚至还会引起郑芝龙的反叛。
要知道郑芝龙本就是海盗出身，一旦他反叛的话后果异常严重，他的舰队和手下的军士基本都是郑芝龙的私兵，如果他冒险叛乱反出大明，那么大明沿海就再也无宁日了，以郑芝龙在海上的力量，足以封锁住大明南海甚至东海区域，而且还会直接影响到山东的海贸进行。
假如海上开仗，先不说有没有把握打垮郑芝龙，这个可能性目前来看并不大。就算有微弱的可能，就算要解决郑芝龙也需要很长的时间。而且这仗一旦爆发，大明刚刚好转的财政就会快速恶化，没了海贸的支持，大明暂时还没能靠自己能力弥补财政上的空缺，何况许多省份因为之前内乱的缘故和气候原因，大明目前都在减免赋税，让百姓休养生息，要彻底恢复需要好几年的时间，如果因为战争原因导致行程中断，那么对大明打击是极其严重的，也是朱慎锥绝对不愿意看见的结果。
考虑来考虑去，朱慎锥决定在设置闽浙总督的同时把洪承畴从湖广总督的职务上调任闽浙，让他来担任这个闽浙总督。
洪承畴的能力非常优秀，可以说是大明如今臣子中能排到前几位的，而且洪承畴不仅能搞民政，还能带兵打仗，当初围剿流寇的时候高迎祥部就是洪承畴和孙传庭两人合作剿灭的，之后配合其他各省围剿张献忠、李自成和罗汝才各部时，洪承畴的战术也可圈可点，说他文武全才丝
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