位极高又手握重权的勋贵死后，五军都督府的权利一下子就成了真空。
而文官集团借着保卫京师的正当理由直接夺权，把五军都督府的大部分权利全部拿走，等到英宗再掌皇权时情况已发生了彻底变化，那时候五军都督府已成了空架子，几乎大部分权利都到了文官手上，之前本打算要文官来制约武将，压制五军都督府的平衡彻底打破。
这也是英宗朝后直到如今五军都督府除了掌控京营外已没其他什么权利，哪怕是京营虽是勋贵作为总戎，可同时也有官员作为协理京营戎政的惯例在。而往往这个协理京营戎政又是由文官来担任，从而导致大明勋贵再也没能力和文官集团抗衡。
朱慎锥的上位是一个特例，因为他不是按部就班登上的皇位，而是举兵以清君侧、靖国难的名义掌控的大权。
由于这个意外，朱慎锥本就执掌军权，而且王晋武还直接担任了京营总戎，但目前的京营已不是以前的京营了，随着这几年不断调整和新军的壮大，京营已成了个空架子，真正的军力是新军，这支新军完全在朱慎锥的手中，除去他外任何人都指挥不动。
改造五军都督府的想法朱慎锥早就有了，他打算用五军都督府的架子重设一个新的机构，这个机构分为三个部分，一部分是参谋机构，也就是依照后世德国的总参谋部例子来设置，组成一个国家军队的专门参谋机构组织，这个组织不统兵，也没调兵的职权，仅仅负责军事的情报收集、判断、推演、参谋等工作，归于内廷，直接向皇帝负责。
这个机构将由勋贵、军中大将等担任，这样的话可以加强国家在军事上的判断能力，成为皇帝的军事智囊和后盾。
除去参谋机构外，还有一个机构就是军校和练兵机构，军校等同于大明的武举，武举制度在大明一直存在，但相比普通的科举却有相当的不完善和弊端，改革这些问题，由此为基础建立从士官到军官的三级军校，再加日常军队训练练兵机构，这样能从下至上影响和改变整个大明的军队体制。
至于最后一个机构说起来和军事方面有些不同，这就是负责评定勋贵袭爵的考评机构。表面上这个机构仅仅是作为袭爵考评使用，按照所制定的军功来确定爵位继承人是否有资格顺利袭爵或者降级袭爵工作，可实际上这个机构朱慎锥是想最终弄成类似于贵族院的议会制度，用袭爵考评来掩饰他的真正用意，一旦这个贵族院最终成立，能起到的作用是常人无法想象的，而且作为皇帝也能借此获得所有勋贵集团的拥护和支持，直接和文官集团
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