士入内阁，由于孙承宗虽不属于东林党，但他和东林党的关系向来不错，尤其又是刘一燝的好友。孙承宗入阁并且接替熊廷弼经略辽东，东林党对此表示赞同，再加上朝廷内外大部分官员也听闻过孙承宗精于军事，所以对天启皇帝的这个任命很快就得到了一致通过。
孙承宗入阁后第一件就是处置辽东问题，他一连几日上书天启，详细说明现在的辽东问题所在，并且提出了一系列解决问题的方案和看法。
孙承宗的态度让天启非常满意，而且他所提出的问题和看法也正如天启下怀，天启给了孙承宗全力支持，让孙承宗放手去干，就这样孙承宗到任内阁没几日就风风火火做了许多事。
由于熊廷弼和王化贞被押解回京后，山海关的明军人心浮动，在孙承宗的一系列举措之下，这种情况很快就得到了明显好转。