荷兰军舰也有损失，不过明显比薛家军海军这面轻很多。
薛云在炮舱里看见多处死伤的薛家军海军炮手，薛云心里非常难过，自己的海军实力比荷兰人差得太远，这样打下去自己的海军损失不知道有多大，而且看不到一点可以获胜的机会，薛云决定实施沉船计划。
第一舰队向后面的船队发出了沉船的命令，早就做好牺牲的旧船，按照舰队的指挥依次驶向大港中心水道，当驶出了二十多艘旧船之后，就没有后续的旧船驶出来，经过武大海一再的催促，另外三十多艘旧船才缓缓驶出来。
薛家军“长江号”“黄河号”战舰还在跟荷兰海军的四艘三桅战舰硬碰硬，而准备沉船的船只还在慢慢悠悠的行动，这次沉船行动是薛云跟赤血公主商量好的，计划第一批是六十艘比较陈旧的海船，现在执行起来执行海船上的船主和船员还是不怎么配合，薛云虽然理解这些人的心情，可是对这些人贻误战机还是非常生气的。
当薛家军的沉船驶到预定位置时，荷兰海军发现这个情况，开始向这些沉船进行射击，这样使得“长江号”“黄河号”两艘战舰压力小了很多，但是“长江号”“黄河号”战舰和其他兵船为了掩护沉船，继续猛烈地向荷兰海军炮击。
经过薛家军海军和满刺加国沉船船队的艰苦努力，用了一个多时辰完成了这次紧急堵塞大港航道的任务，不过由于荷兰海军的炮火凶猛，这次堵塞大港航道在沉船位置上没有全部完成预定目标，留下了一些堵塞薄弱的缺口。
随着大港航道的堵塞，荷兰海军像泄了气的皮球，可是缓缓的退回合江内海里去了；薛家军海军这边也抓紧搜救因为沉船落水的船员，抢救受伤的薛家军海军官兵，与此同时两军将士的目光都聚焦在陆军的战斗上来了。
如果说荷兰海军占了上风的话，那么荷兰陆军的处境用糟糕来形容一点要不为过，首先是鹿耳门港右面的孤岛失手，岛上的六十多个荷兰士兵和武装分子非死即降，至此鹿耳门港水道中间的两门佛郎机火炮落入薛家军手里，加上早些时候薛家军控制的左岸地区和两门佛朗机炮，整个鹿耳门港被薛家军完完全全的控制了。
薛家军在普罗民西亚城堡的南端登陆后，并没有向普罗民西亚城堡进攻，二叔继续向岛内延伸，对普罗民西亚城堡形成半包围，这样普罗民西亚城堡里的荷兰人就西、南面临明朝薛家军。北面是合江内海，剩下的唯一没有封闭的就说东面，这里只能逃到西拉雅族同盟者那里，或者去深山老林跟台湾岛高山土族混在一起。
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