商毅的人马是在七月初二到达庐州。而这时吴甡等着他,以是等得望眼欲穿了。
虽然吴甡比商毅动身的时间早了大半个月，但北京离庐州更远一些，而且中原地区以被李自成所占，还必须绕着道走，再加上吴甡又是刻意放慢了行军的速度，因此只比商毅提前了七天到达庐州。
之所以把这次吴甡南下督师的地点放在庐州，是因为长江中游的地区被农民军占领，特别是武昌失守，导致南京吃紧。崇祯最担心的就是农民会顺江而下，一举攻克南京，席卷江南诸地。南京不仅是明朝的第二首都，同时也是整个江南地区的屏障，而现在明朝的财政收入有七成来自于江南地区，因此南京一但失守，不仅仅意味第二首都失守，而且等于是彻底切断了明朝的财政收入来源。
在这种情况下，吴甡南下督师的首要目地，就是先要保住南京不失。然后再能再谈其他的事情。而庐州就是南京的门户，左良玉己驻军在九江，吴甡再守住庐州，基本就可以保证南京的安全了。
不过吴甡在南下的过程中，虽然走得不快，但他也不是一点事情都没有做，而且在沿路上尽力招集地方军马，扩大自己的队伍，使人马达到了五万余人。同时又下令驻守在安庆府的刘良佐和黄得功部也得自己靠陇，分别驻守六安州和庐江，保护庐州府西南入口。而且这样一来，加上刘良佐和黄得功部至少在名议上，吴甡手里以经拥有了近十万的大军。
同时吴甡也深知手里只有人马还不行，因为人要吃，马要喂，还要有银子才能使士兵卖力作战，没粮没钱,就什么事也办不了.因此又让南京的兵部尚书史可法，筹备粮草军资，运抵庐州以供军用，以便人马到了庐州之后，至少在后勤补济方面有充份保障。
事实上在这个时候，崇祯选择吴甡南下督师也不是没有道理。吴甡为人虽然狡猾了一些，但还是有相当的能力，早在崇祯六年（1633年）的时候，就干过剿贼镇抚的事情。可以说在目前来说，无论吴甡能不能担负起督师平乱的重任，但也只有他是最合适的人选了。
史可法也是十分尽职尽责的官员，和吴甡又是同属于一个阵营的——都是东林党人，因此对平乱的事情也十分上心，亲自劝说江南的富户巨商，勋戚豪门，支助钱粮物资。
而武昌的失守对南京的震动还是非常大的，张献忠可是有名的杀人魔王，整个江南地区都有些人心惶惶，但心张献忠会顺江而下,直取南京。而且江南一带基本都是富饶之地，又是全国最大最重要的产粮区，尽管现在是明末
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