在位，后来杜化中的官路也颇为坎坷，初为绛州通判，再贬谪为榆州知县、汶上知县。后迫于朝中舆论，才稍迁东平知府。
在万历皇帝即位后，张居正得到进一步信任，更加专横跋扈。他竟假传圣旨，不但驱逐了政敌高拱高阁老，而且排斥河南、河北籍的官绅，其中张居正最为嫉恨的杜化中也被削职回家。
如今张居正一系被清算，杜化中因为曾任工部主事，当时监督大内各项工程建筑的建造，节省了不下数十万金，廷论咸以为能，此刻宫中又有太后殿阁需要营造，故而旧友推举之下，有工部任职督造经验的杜化中便出任了正五品工部营缮清吏司郎中。
这才是刚刚到京不久，杜夫人外出购买首饰时便遇到了张籍，见到了那只络子。
说完这些，杜夫人言道：“维桢，可否将汝夫人的闺名的写在纸上，你我对上一对？”
这样做的话更加保险，张籍自无不可，于是点头道：“此举大善。”