有弹性学制，可于3至6年间完成本科教育。可学校教务不予延期的理由是，这名学生的毕业学分已修满。
经过协调，吕伟聪的申请最终被批准。但此事在元培内部仍引起后续讨论：元培没有摆脱“双轨制”的麻烦，学院的一些教学制度，在学校层面得不到有效的行政保障。
虽然“双轨制”并没有随着时间推移完全消失，但许崇任表示，元培学院是建立在生源多样化基础上的一种有益于本科教育改良的模式。元培的改革，针对高等教育的两大突出问题：学生过早进入专业学习导致知识面偏窄；大多数学生盲目选择专业，学习后出现落差。
“北大就是要将相同的学生培养成不同的人。”许崇任称，元培为学生们提供了更多的选择机会，它不一定适合所有学生，但有其存在的必要性。”
4、通识课程的边缘化
无论“通识”还是“博雅”，字面上都强调知识广博。中国大学在开展通识教育时，一个常见做法是要求学生选修本专业之外的课程。
北大开设了五大类通选课程，涵盖了数学与自然科学，社会科学，哲学与心理学，历史学，语言学、文学与艺术，学生必须在每类中至少完成一门课程方能毕业。
这种做法部分参考了美国精英大学的课程表，其中最知名的当属芝加哥大学为低年级学生的“核心课程”。
这种做法部分参考了美国精英大学的课程表，其中最知名的当属芝加哥大学为低年级学生的“核心课程”。
核心课程包括人文学科、数学和自然科学、社会科学三大类科目，强调西方古典人文传统、经典阅读和批判性写作，负担重，标准高，绝不是学生可以在专业课程之外稍加努力即可过关的，因此芝大的学生实际在第三年才开始将全部精力放在主修课程上。
相比之下，一个北大学生毕业需要完成140学分，而通选课程仅占16学分，其余的是专业必修课、专业选修课、英语课、政治课。
低年级时学生的大部分精力耗费在专业课程上，到了高年级则忙于实习、找工作、申请海外研究生院和毕业论文，大学的有效教学时间实际上只有三年。
北大老师为通选课投入了相当的热忱和心力，执教通选课的老师不乏国内相关领域的一流学者，但缺乏核心课程这一制度保障，意味着通选课至多是专业课之余的调剂，元培的学生并没有特殊待遇。
一般来说，美国顶尖大学的学生每学期需要完成三到四门课程，但每门课程
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