傕、郭汜、张济等人无所依靠，便遣使去长安请求赦免。王允为人刚直，竟没有同意，李傕等人更加恐惧，不知所为，准备各自解散部队，逃回乡里。贾诩为求自保，便出面阻止了他们，说：“听说长安传闻要杀尽西凉人，要是你们弃众独行，一个亭长就能把你们抓住。不如带领部队向西，沿途收敛士兵，再进攻长安，为董卓报仇，如果能够幸运地成功，就可以在朝廷的名义下征讨全国，如果不能成功，再逃走也不迟。”这个计划被众人采纳。李傕等以替董卓报仇为名，联络西凉诸将，率军袭击长安，等到长安城下，已聚合10余万人。李傕与樊稠、李蒙等围攻长安城，因城防坚固而不能攻克。后由城内叛变士兵引导李傕军入城，与守将吕布展开巷战，吕布兵败，仅率百余骑出逃。李傕等纵兵掳掠，吏民死者万余人，尸积满道。一时间，京城腥风血雨，朝野大乱。事成后，贾诩被任命为左冯翊。李傕等以贾诩之功欲封其为侯，贾诩说：“这是保命的计谋，哪有什么功劳？”坚决不受。李傕等又让贾诩为尚书仆射，贾诩说：“尚书仆射是百官的师长，是天下的榜样，我贾诩一向没有什么名望，难以服人。就算我可以贪享虚荣，对国家又有什么好处？”于是改拜贾诩为尚书，掌管选拔人才，在人事方面多有贡献，李傕等人亲近贾诩但同时也很惧怕他。不久，贾诩的母亲去世，贾诩辞掉官职，后来又被拜为光禄大夫。
[195年]，李傕、郭汜、樊稠三人互相猜忌，争权夺利，争斗起来，李傕使骑都尉胡封刺死樊稠。不久，李、郭之间矛盾日益激化，开始交兵，李傕请贾诩为宣义将军，来帮助自己。后来，李、郭二人讲和，放出被劫持的献帝和朝臣，对此贾诩作出了很大努力，之后贾诩便上还官印。当时将军段煨与贾诩同郡，屯驻华阴，贾诩去投靠段煨。贾诩向来知名，为段煨军所敬服，段煨心里怕贾诩夺其兵权，但在表面上对贾诩十分礼遇。贾诩看出后，心不自安。南阳张绣与贾诩暗中有来往，张绣便派人去迎接贾诩。贾诩临行时，有人对贾诩说：“段煨待你这么好，你为何还要离去?”贾诩说：“段煨生性多疑，有猜忌我的意思，待遇虽然优厚，却不可依靠，待久了一定会被他所害，而我离开他一定很高兴，又指望我连结外援，一定善待我的家人。而张绣缺乏谋士，也很愿意得到我，这样我和我的家人都能够得到保全。”贾诩到达张绣处，张绣果然大喜，率子孙前来迎接。而段煨知道贾诩离去，也果然善待其家人。
[198年]，曹操南征张绣，包围张绣据守的穰城。不久，曹操闻袁绍欲趁虚袭
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